柯南世界发生了一个大事，神秘组织被出卖，成员四散。
年轻的机械天才长谷川被自家的药水变成了小孩子，还成为了柯南团队里的一员。
世事无常，柯南一直想要追寻的组织，原来近在咫尺。
只是这时的长谷川只想找到坑害自己的叛徒。
于是利用柯南的天才大脑和自己的千机伞机械技术一起开始了案件侦破。
这时一个神秘的女子出现了。
初见灰原哀的时候只觉得她看向自己的眼神不太一般。
为什么会有这种感觉？我应该不认识她才对啊......
直到后来，长谷川才知道原来那并不是他们的第一次相见。
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